水草缸中的藻類很多種，黑毛藻算是出了名的難纏，多數的除藻生物對它興趣缺缺，使用藥劑清除風險又很大，所以一旦遇上這難纏的傢伙大爆發，肯定讓許多玩家傷透腦筋不知所措，甚至不惜以翻缸這樣的大工程來因應。
由於多數的藻類只要掌握幾個重點（停肥、換水、放養更多除藻生物）都不難解決，唯獨黑毛藻沒這麼容易搞定，因此板主特地在之前宗洋水族主辦的兩場講座內容中加入了『如何對付難纏的黑毛藻』這個主題，藉此與玩家們經驗分享。
不過並不是所有玩家都剛好有時間能參加講座，所以板主就將當時講座所準備關於『如何對付難纏的黑毛藻』內容在此與大家分享。
缸中一旦發現黑毛藻該怎麼處理？
不用翻缸！不用翻缸！不用翻缸！
因為沒有很重要，所以只講三次（很重要的話會講30次）。
翻缸真的工程太浩大了，而且之後黑毛藻再度復發的機會還是有，總不能一發現黑毛藻就一直翻缸吧。
板主建議處理黑毛藻要『因地制宜』....
也就是說要看黑毛藻長在何處，再來決定用何種方法處理，首先我們從最簡單的地方說起，如果黑毛藻長在硬體設備上，最常見的就是長在進出水口、雨淋管或油膜處理器上頭。
遇到這種情況算是最容易搞定的，只要將這些長了黑毛藻的硬體設備取出，浸泡漂白水10分鐘左右（無需稀釋），黑毛藻就會立即白化死亡，再以清水稍微沖洗一下就搞定了。
第二種情況是黑毛藻長在硬景觀（石頭或沉木）上頭，已經擺設完成的硬景觀不像硬體設備那樣可以輕易取出缸外浸泡漂白水，所以處理上會稍微麻煩一些些（但也沒有很麻煩啦）。
這時候就是戊二醛登場的時候了，特別提醒一下，市面上的戊二醛有幾種不同濃度比例，一般不建議使用濃度太高的戊二醛，所以板主都是使用2.5%的就可以了。
將缸中的水位降低到硬景觀能露出水面為止，然後用水彩筆或毛筆沾濃度2.5%的戊二醛直接塗抹於硬景觀上，靜置個10分鐘左右，此時直接接觸到戊二醛的藻類肯定是難以存活的，接下來再把水加滿，注意！到這還沒結束喔，因為缸中殘留的戊二醛濃度如果太高也會毒害生物，尤其大和藻蝦對戊二醛又特別敏感，殘留過多恐怕接下來會引發一場生態浩劫，所以此時記得做一次大量換水，也就是將缸中的水再次抽掉（建議至少抽換80%的水）後換入新水（新水要除氯或曝氣喔），這樣殘留的戊二醛濃度就會大為降低，也比較不會造成生物死亡了。
這麼一來，硬景觀上的黑毛藻就清除掉了。
第三種情況就是黑毛藻長在水草上頭，該怎麼辦？又不能塗抹戊二醛，塗了只會讓黑毛藻與水草"同歸於盡"，不過這時也別擔心，其實這狀況也是很容易處理的，就看你捨不捨得了。
先看看黑毛藻是附著在什麼樣的水草上頭，如果是附著在生長速度較快的草種（大部分的水草生長速度都不慢） 那就好處理了，拿出你的剪刀，不用客氣，把水草上附有黑毛藻的位置全部剪掉，乾脆讓水草重新再長就好了，頂多幾週的時間水草就會再度茂盛， 這樣就不用再那裏傷腦筋要如何慢慢對抗黑毛藻了。
但如果黑毛藻是附在生長速度很緩慢的水草上頭呢？這時可不能再拿起剪刀了，因為他都已經長很慢了，你再一直剪....恐怕就看不到它茂盛的一天了。
此時另一項武器就該登場了，檸檬酸（一般家庭五金行都能買到），檸檬酸溶液的PH值很低，但無毒，黑毛藻不大能承受這樣低的PH值。
所以只要將缸中的水位降低或直接取出小榕（或辣椒榕）這類的水草塗抹檸檬酸溶液（大約1g檸檬酸配10cc的水），靜置個10~20分鐘，附著在水草上的黑毛藻也會漸漸白化死亡。
由於檸檬酸無毒，不像戊二醛那樣，所以缸中再加滿水之後不用再多做一次大量換水的動作，使用上相對安全許多。
好了，現在不管黑毛藻是長在缸中何處，以上這幾個步驟都能很快的將它清除掉。
但消除黑毛藻並不能只靠這些方法，『預防勝於治療』，除藻生物的即時放養（越早越好）、肥料的適度控制 、足夠的CO2供應等條件不能忽略，不給黑毛藻有再度爆發的機會才能讓美景長久維持。
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